O DNA, é um ácido nucléico (ácido desoxiribonucléico) que contem as informações genéticas, sendo constituído por nucleotídeos. Estes são compostos por uma base (purina ou pirimidina), um açúcar deoxiribose e um grupamento fosfato. No DNA as purinas são representadas pelas bases adenina (A) e guanina (G), enquanto as pirimidinas são representadas por timinia (T) e citosina (C), e no RNA há uma base adicional dentro das pirimidinas chamada de uracila (U).
A cadeia de nucleotídeos é formada pela união de um grupo hidroxila no açúcar de um nucleotídeo ao grupamento fosfato ligado ao açúcar do nucleotídeo seguinte. A cadeia de DNA é polar, resultante do modo pelo qual os açúcares se ligam um ao outro. O grupamento fosfato na posição C5 (o carbono 5´) de um açúcar se liga ao grupo hidroxila da posição C3 (o carbono 3´) do açúcar seguinte através de uma ligação fosfodiéster. Consequentemente, uma ponta da cadeia aprensenta um grupamento fosfato 5´ livre e a outra ponta um grupamento hidroxila 3´ livre. Estas pontas livres fazem com que a direção da sequência de nucleotídeos seja da ponta 5´ para a 3´.
A estrutura química dos nucleotídeos determina a estrutura do DNA e RNA, onde uma purina (A ou G) se encontra oposta a uma pirimidina (C, G ou U). Assim, o pareamento entre estas bases ocorre da seguinte maneira: A pareia com T e C pareia com G, no DNA; no RNA A pareia com U e C pareia com G. Este pareamento se deve a pontes de hidrogênio que se formam entre as bases complementares. Assim, entre A e T há duas pontes de hidrogênio enquanto entre C e G há três pontes de hidrogênio. Este é conhecido como o pareamento clássico de Watson e Crick que ocorre no DNA e RNA, contudo no RNA transportador (tRNA), que será discutido posteriormente, pode também ocorrer o pareamento chamado de "Wobble" onde G pode parear com U e uma base chamada Inosina (I) pode parear com U, A e C.
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